W zdecydowanej większości przypadków kandydozy jamy ustnej winowajca jest ten sam: drożdżopodobny grzyb Candida albicans, który normalnie żyje w jamie ustnej prawie każdej zdrowej osoby, nie powodując żadnych objawów — dopóki coś nie pozwoli mu się namnażać w sposób niekontrolowany. Tym „czymś” jest zwykle osłabiony układ odpornościowy, tygodnie bez odpowiedniej higieny jamy ustnej lub niektóre leki zaburzające równowagę mikrobiologiczną w jamie ustnej.